Die Protoss studieren schon seit Tausenden von Jahren die Natur von Raum und Zeit. Den Wissenschaftlern gelang es nach aufwändigen Experimenten, dem Universum viele seiner Geheimnisse zu entlocken. Unter der Verwendung von psionischen Fertigungsprozessen erschufen die Protoss schließlich ein künstliches Bewusstsein, dessen Programmierung in die Moleküle eines fortschrittlichen Kristallgitterkerns eingebettet ist. Dieser "Kristallcomputer" ist in der Lage, Materie und Energie so präzise zu manipulieren, wie es einem organischen Verstand nie möglich wäre.

Phasenprismen werden von den Protoss auf unterschiedlichste Weise verwendet. Die Hauptfunktion einer solchen Einheit ist der Transport von Protosstruppen auf dem Schlachtfeld. Organische sowie nicht organische Objekte werden von den Phasenprismen in Energie umgewandelt. Ihre einzigartige Energiesignatur wird dabei in dem Kristallgitterkern des Prismas gespeichert. Die gespeicherten Energiesignaturen werden im Umkreis dieser Einheiten wieder in Materie umgewandelt.

In seiner zweiten Funktion fungiert das Phasenprisma als mobiler Fokus für die Psi-Matrix der Protoss. Nach dem Aufstellen des Prismas versorgt es alle umliegenden Protossgebäude mit Energie. So konfigurierte Phasenprismen werden häufig als zeitweiliger Ersatz für zerstörte Pylonen in einer Kolonie eingesetzt oder ermöglichen den schnellen Aufbau eines Vorpostens.